Si al iniciar un proyecto directamente desde la administración de proyectos no se desconecta explicitamente esta opción, siempre se creará un protocolo de ejecución detallado durante el procesamiento de un proyecto, en éste consta claramente todo lo que se ha hecho en que momento con que fuente de datos y si han ocurrido errores. Además se hará un backup, siempre que los datos de una fuente de datos se modifiquen o borren directamente. Este contiene todos los registros modificados o borrados y se creará como fichero de texto, parecido a un fichero de archivar. En el caso de ficheros Excel se hará una copia del fichero original como backup. Mediante las opciones, el listado de datos aplicaciones donde se colocan los protocolos y los backups puede ser movido. A pesar de este mecanismo de seguridad recomendamos seguir haciendo backups de sus datos regularmente fuera del entorno de BatchDeduplicator.